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소장의 일부분이 소실되어 일어난다. 증상은 복잡하고 종종 생명을 위협하는 병이다.
소장의 손실은 질병이나 외과적 제거술 때문에 일어날 수 있고, 국내에 수백명 가량 있는 것으로 추정된다.
단장증후군 환자는 소장에서 음식물로부터 영양소를 충분히 흡수할 수 없기 때문에 중요 영양소의 결핍이 생기기 쉽다. 흡수장애의 상태에서 영양소를 가능한 더 흡수하기 위해 소장은 늘어나고, 표면적을 늘이는 방향으로 보상하게 된다.
